《沙耶之歌》是一部毁在商业运作和制作之下的完美艺术作品。
这个故事通篇充斥着血肉、黏液、腐烂和异臭，然而她却又纯洁得不能再纯洁，恶臭和血肉中的世界，吃人内脏的情侣，他们的爱情丝毫无垢，所有人接触《沙耶之歌》后恐怕都会有下面的疑问：
腐肉和鲜活的人谁更干净？
异类和人类谁才是正常的？
究竟什么是腐臭，什么是芬芳？
主人公失去“正常”感知之后的世界，和你我眼中的这个世界，哪一个更加恐怖？
在别人的眼中，你究竟是一个“人”还是一个“怪物”……？
故事的主人公是两个陷入无穷绝望，一直孤独地生活在各自的世界，惊恐地却又没有选择地活在不属于自己的世界，并且相互爱上了异种族生物的二人。
沙耶（さや）
CV：川村みどり（高野直子）
突然出现在匂坂郁纪（本作主人公）面前的神秘少女 ，正在寻找失踪的父亲奥涯雅彦教授。在郁纪眼中的世界里沙耶是唯一正常的存在、沙耶也因此成为郁纪的精神支柱，对于住院中的郁纪来说，与沙耶的相遇是命运的相遇。同时沙耶也对爱着自己的郁纪心存好感。吃掉了闯入郁纪家的青海。手机结局中将郁纪的感官恢复了正常，自己离开了。全灭结局中将瑶改造为同类送给郁纪当玩具，最后被凉子重伤，和自杀的郁纪携手死去。开花结局中将瑶改造为同类送给郁纪当玩具，杀死了耕司，最后化为孢子改造了整个世界。
匂(xiōng)坂 郁纪（さきさか ふみのり）
CV：冰河流（绿川光）
就读于医科大学的主人公。因为交通事故家族全灭，自己也深受重伤，但在不可思议的恢复后回到了大学。由于知觉障碍，风景和人物看上去都像肉块和脏物一样。在这个疯狂世界中，遇到了唯一看上去正常的少女，并且同居中。手机结局中感官最终恢复了正常，但被作为精神病人送进了监狱。全灭结局中杀死了凉子后自杀。开花结局中生活在被沙耶创造的幸福世界中。
戸尾 耕司（とのおこうじ）
CV：片冈大二郎（松本保典）
郁纪的好友。对于郁纪事故后突然改变的态度感到可疑，想和青海以及瑶共同努力回复同郁纪的关系。因此踏入了郁纪疯狂世界中。全灭结局中因目睹真相精神失常【又一说精神失常后开枪自杀，见原作小说（虽然游戏中最后没有自杀，但种种迹象表明他最后买的一颗子弹是为了自杀）】。开花结局中被沙耶杀死并吃掉了。
高畠(zāi) 青海（たかはたおうみ）
CV：海原エレナ（横手久美子）
耕司的女朋友，瑶和郁纪的好友。对于郁纪事故后的忧郁的瑶感到担心。在看到郁纪对瑶粗鲁言语后，打算同郁纪谈谈，却被留在郁纪家的沙耶发现并吃掉了。
