《魂斗罗2代》是一款列卷轴射击类单机游戏，是魂斗罗的续作。公元2634年12月，地球联邦南美GX军第7方面军在举行军事演习时突然发出求救信号，联邦军在分析之后认为是“红色猎鹰”的残党和外星人所为，于是，魂斗罗小队的上等兵比尔·雷泽和兰斯·比恩再次出击
游戏的系统与前作基本相同，但有了一点细微改动：前作中由红色猎鹰表示的武器在本作中全部改以枪表示，部分武器形态也发生变化。比如前作的火焰枪F由旋转小火球变为会发散的大火球。霰弹枪S变成取得一个时一次发射三颗子弹，取得两个时发射五颗。前作中的纵深版面被取消，取而代之的是可向八方向移动、射击的俯视画面。在俯视画面中可以得到令画面内敌人瞬间全灭的炸弹， 发动时机可由玩家决定，这个设定后来被SFC版沿用。游戏难度之于前作大幅度提高，被认为是系列所有作品中最难的之一。
日版的标题为《超级魂斗罗》，去掉了街机版的副标题“异形的反击”（エイリアンの逆袭），而美版的标题则为“Super C”。欧洲版标题为“Probotector II - Return of the Evil Forces ”，主角与敌人依然是机器人。
游戏中武器的表示改回前作般的猎鹰，但颜色变为红蓝两光交替闪烁。霰弹枪S取消级别的设定。
俯视画面中的炸弹被取消，改回FC版前作般的无字母猎鹰，接到时令画面内敌人全灭。
在本作中同样存在生命数增至30的秘技，但改为在标题画面中输入右左下上AB。在美版中，这个秘技只能将生命数增加至10。
公元2631年9月12日，一颗神秘的陨石坠落在新西兰附近的加尔加群岛上。
两年以后的2633年12月，联邦军司令部得到消息，说一个叫做“红鹰”的武装组织开始把加尔加群岛地区修建成一个发动异型侵略战争的基地。于是，防卫军“魂斗罗”成员比尔·雷泽【Bill Rizer(ビルライザー)】和兰斯·比恩【Lance Bean(ランスビーン )】被送去破坏对方的计划。这次行动获得圆满成功，但是海军部门将有关这次事件的信息作为高度机密，完全未向大众公布。之后的一年 [1] 。公元2634年12月，地球联邦南美GX军第7方面军在举行军事演习时突然发出求救信号，联邦军在分析之后认为是“红色猎鹰”的残党和外星人所为，于是，魂斗罗小队的上等兵比尔·雷泽和兰斯·比恩再次出击。
