口袋妖怪系列之前曾经推出过“红、绿”两个版本的GameBoy专用RPG，后来更推出“金、银”等版本与众多相关商品精品等等，可说是非常受到喜爱的一款作品系列。在这次最新作中，除了有新的神奇宝贝登场之外，另外两个版本中登场的神秘组织敌人也都不一样。虽然在两个版本中准备有同样内容的剧情故事，但各场景的角色、对白都可以各自替换。
游戏最大的乐趣并不只是在战斗，而是收集、捕捉各种各样可爱的精灵，完成口袋妖怪图鉴。因为很多精灵在游戏中只有1只，而且一旦捕捉失败就没有第二次的机会，能够说极度的珍贵，加上每部作品的最后一只精灵更是要通过特殊的方法才能得到，所以，精灵的捕捉更是成为游戏一大乐趣。
1、游戏一开始时玩家还可以自由选择主角的性别。
2、依玩家性别不同，另一个性别主角也会以游戏中帮助主角的博士小孩身份登场，并向主角进行口袋妖怪的挑战。
3、玩家必须打败他才能拿到会自动记录游戏资料的妖怪图鉴与捕捉妖怪的捕捉球。
4、另外玩家也可以藉由对战线与朋友交换彼此的口袋妖怪或是进行最多四人同时参加的双人对战或多人对战。
映月兽：映月兽(游戏名)在日落山那个幽灵墓地的最顶楼，来到有个洞会陷进去的地方，在那附近遇怪即可遇到！
海王牙：海王牙在破沉船那，在一间房间里可以潜水的地方潜水到另个房间！然后在那个房间钓鱼，用最好的鱼干钓即可遇到！
蓝色水都护神：蓝色水都护神是流动性的怪兽，只有一只，杀了便没有了!通常出现在海上，带只39级的怪，吃不遇怪的噴射器！在海上，即可遇到!建议在遇到的话就用最好的球抓，它一战斗就跑!如果没抓到，可以用图鉴来追踪！
红色水都护神：红色水都护神，在130水道上便可遇到！
火狮，雷虎，水狼，在觉醒寺的二，三，四楼即可有机会遇到!遇到的话，记得用计时存档！因为他们有赶玩家跑的技能！
七彩凤凰：七彩凤凰在日落山一对老夫妻那，在左便的草堆中遇怪即可得到！
若基亚：若基亚在124号水域用潜水技能，在海底，即可遇到！
雪拉比：雪拉比在凹凸岛草坪中即可遇到！
超梦：超梦在天柱的第二楼掉下去的那！那是通往第三楼的，在那即可遇到！
梦幻：梦幻在流星瀑布那遇怪即可！
